Nenechte hněv cloumat svým majestátem S lhůtami dle správního řádu by to bylo veselé, kdyby to nebylo tak smutné. Prakticky jediným způsobem je stěžovat si do 30 dnů od podání žádosti. Veselé i smutné je, že lhůta pro vyřízení je 30 dnů + dalších 30 dnů za každé šetření. Pokud se čeká na nějaké stanovisko, běh lhůt se zastavuje. Ale stížnost lze podat jen do 30 dnů (to vás ale upozorní, že mají čas).
Ve vašem přídadě mám za to, že došlo k marnému uplynutí lhůty. Ale neznám detaily vaší následné dohody o přerušení řízení, takže si nejsem jist, zda lze jednuduše aplikovat § 66 odstavec d správního řádu (řízení se zastaví, pokud žadatel nezaplatil správní poplatek).
Nejjednodušší pro vás je vzít žádost zpět. Máte několik možností, nejvhodnější důvod je asi dle § 66 správního řádu, odstavec g - žádost se stala zjevně bezpředmětnou.